Å angi en prognose innebærer å gjøre en vurdering i hvordan en sykdomsprosess vil forløpe fremover i tid. Dette baseres i odontologien på in vivo studier. Da målet for rotfyllingen er forebygging eller behandling av apikal periodontitt, er det forholdet til apikal periodontitt som vurderes. Prognose vurderes oftest ut i fra den preoperative diagnosen:
- Vital pulpa eller nekrotisk pulpa uten rtg-ologiske tegn til apikal periodontitt 90-95%
- Apikal perio 70-85%
- Revisjonsbehandling 50-67%
I tillegg må det tekniske arbeidet vurderes; hvordan var aseptikken, hvor tett virker rotfyllingen, og ikke minst hvordan er rotfyllingsnivået (teknisk standard).